La Cofradía de Jesús Nazareno se ha regido a lo largo de su historia por las Reglas de 1579, 1857, 1972, 2001 y 2013.
El 21 de marzo de 1579, son aprobadas las Reglas fundacionales de la Cofradía de Jesús Nazareno y San Bartolomé por el obispo fray Martín de Córdoba y Mendoz y siendo Papa Gregorio III. Se configura como una Hermandad de penitencia, quedando así instaurada con las nuevas formas asitenciales derivadas del Concilio de Trento y la contrarreforma.
Después de sufrir la Cofradía una crisis en 1793 y permaneciendo sin realizar su Estación de Penitencia, el 9 de marzo de 1850 se vuelve a reorganizar la Cofradía y se plantean unos nuevos estatutos, siendo aprobados el día 20 de noviembre de 1857 por el obispo D. Juan Alfonso Alburquerque Berión y siendo Papa Beato Pio IX , que con una real cédula de Isabel II se le otorga a la Cofradía el título de Real.
Tras el letargo que sufre la Cofradía entre los años 1940 a 1971, en 1972 se vuelve a reorganizar la Cofradía dotándola de unos nuevos estatutos, siendo aprobados en marzo de ese mismo año por el obispo D. Jose María Cirarda Lachiondo y siendo Papa San Pablo VI. En 2001 son adaptados los estatutos al Estatuto Marco propuesto por la Diócesis de Córdoba, siendo obispo D. Francisco Javier Martínez Fernández durante el pontificado del Papa San Juan Pablo II.
Finalmente es incorporado al nombre de la Cofradía como Titular el Beato Padre Cristóbal de Santa Catalina en el año 2013, siendo obispo D. Demetrio Fernández González y siendo Papa Francisco, pasando a ser Real e Ilustre Cofradía de Nuestro Padre Jesús Nazareno, María Santísima Nazarena, San Bartolomé y Beato Padre Cristóbal de Santa Catalina.